Nedávná genetická analýza několika ostatků lidí z kultur Džómon, Jajoi a Kofun ukázala, že dosavadní představy o původu Japonců byly mylné. Až dosud se předpokládalo, že Japonci jsou mixem mezolitických lidí kultury Džómon a zemědělců Jajoi, kteří přišli z Korei.
Nyní se ukázalo, že zásadní podíl na formování japonské populace měla kultura Kofun, ta tvoří nejvýraznější podíl v genetickém profilu dnešních Japonců.
Genetický profil populací jednotlivých japonských kultur/období a současných japonců.
Ukazuje se navíc, že lidé kultury Kofun nepochází z Korei, ale mají nejblíže k současným Číňanům. To je zajímavé z hlediska vzniku Japonštiny, u které se předpokládá, že má souvislost s korejským královstvím Silla. V něm se zřejmě mluvilo jazykem, který byl podobnějším dnešní japonštině než současné korejštině. Je překvapivé, že nejvýraznější genetická složka (čínská) nezanechala výraznější jazykový vliv na japonské populaci. Vysvětlením může být, že lidé z migrační vlny z Číny se podvolili již existující proto-japonské elitě, formovené kulturou Jajoi a přijali její jazyk.
